Como iniciar la contabilidad de una tienda

Me han ofrecido llevar la contabilidad de una tienda que ya lleva años funcionando. Es autonoma y tributa por modulos. La cuestion es como empezar la contabilización informatica.
No está obligada a llevarla pero quieren tenerla para llevar las cuentas más claras.
Mi duda es si tengo que crear cuentas de capital, primer establecimiento, etc, si no es una sociedad y hace años que funciona, o bien solo contabilizo gastos e ingresos.
i además ¿Cómo me cuadrarán los bancos, si empiezo a contabilizar facturas de proveedores y los pagos que se hacen en ese mismo dia son de facturas anteriores?

Muchas gracias por vuestras aportaciones.