Impuesto sociedades complementario y cuentas anuales pendientes

Despues de presentar el I.S.año 2007 en julio 2008 se vio que habia un error y se hizo una sustitutiva en diciembre 2008 generando el pago de la diferencia entre lo pagado y el importe real que ha sido mayor. Las cuentas anuales están pendientes y al ir a prepararlas me surge la duda de si hay que hacer dos certificaciones de aplicacion de resultados(con fecha 30.06.08 la primera y con la fecha de diciembre 2008 la seguna), o basta con una sola certificación a fecha 30.06.08 por el total de los resultados 2007 y en algún apartado de la memoria hacer la indicación de lo sucedido.
Muchas gracias